Atoll Electronique została założona w 1997 roku przez dwóch braci: Stéphane'a i Emmanuela Dubreuil. Od początku powstania marki przyświecał im jeden cel: wypełnić niszę w rynku odnośnie sprzętu audio klasy hi-end, ale przystępną cenowo. Tak powstały modele: IN50, IN80, PR100, AM50, AM80. Atoll wszedł na rynek z dwoma wzmacniaczami zintegrowanymi, przedwzmacniaczem i końcówkami mocy. Przyjęcie tych urządzeń było tak pozytywne, że po 25 latach modele te nadal są w sprzedaży - oczywiście będąc modernizowanymi z biegiem czasu.
Już rok później, w 1998 roku, Atoll przedstawił swoje pierwsze urządzenia źródłowe - odtwarzacze CD Atll CD50, CD80 i CD100. Sukcesywnie, z roku na rok Atoll Electronique rozwijał swoją ofertę i stopniowo budował swoją rozpoznawalność w świecie audio. Obecnie jest to marka z bardzo szeroką ofertą, uwzględniającą również przetworniki DAC, np. Atoll DAC100 czy urządzenia typu all-in-one takie jak Atoll SDA200.